Quan es desinfecten els components del respirador, s'han de desmuntar i netejar amb un desinfectant que contingui clor.Els components resistents a la calor i a la pressió es poden autoclauar millor.

Per a les peces que no siguin resistents a la calor o a la pressió, es poden utilitzar mètodes alternatius, com ara l'esterilització per plasma amb peròxid d'hidrogen o el remull en una solució de glutaraldehid neutre al 2% durant 10 hores.

Els tubs i les bosses del respirador s'han de substituir cada 48 hores.Si l'acumulació d'humitat és severa, es recomana una substitució més freqüent.

Els nebulitzadors s'han de netejar i desinfectar diàriament amb pressió de vapor.Es poden utilitzar humidificadors d'un sol ús dins de la instal·lació, si estan disponibles.

A més, connectar el respirador a unesterilitzador de circuits respiratoris per anestèsiapermet netejar i desinfectar el tub intern.A més, col·locar la màscara respiratòria a la cambra d'esterilització de l'esterilitzador de cicles pot garantir una desinfecció completa.

L'esterilització dels components del respirador és una opció beneficiosa per prevenir la contaminació creuada i protegir tant els metges com els pacients.En adherir-se a aquests protocols de desinfecció, un entorn higiènic a la unitat mèdica reduirà el risc d'infecció.